土烟叶特税的纳税人为收购烟叶的烟草商、运输商或在产地临时设庄的商人。土烟叶特税由主管机关在产地设驻场员或稽征所一次征足。纳税人在售出、运出烟叶前，应报税务人员验明烟包，按照市斤逐一过秤后按净重量征收特税，并填发完税照。在本埠销售的，应报稽征人员，在税照上加批注明。运销外埠的，应报明销售地点，并于烟包上监贴印照、加盖戳记，方准运销。由非特税区域运入的烟叶及烟丝，由入境第一道征税机关征税，手续与特税区域相同。由非特税区域运入另一非特税区域，仅经过特税区域的货物免于征税。完税的烟叶运出或到达他处时，实际重量超过其所完纳的税额，应照章补税。这是特税区域内稽征土烟叶特税规定的通行办法。
　
　　　甘肃省兰州市生产的青烟（水烟的一种）是一种特殊情况。青烟又名西烟，运销路线由产地运到陕西潼关，装陇海路火车运至江苏的大浦地区，再转运上海分销各地。按土烟叶特税章程，应由入境第一道特税机关及河南省陕县烟酒税稽征分局征税。由于铁路负责运输，经过陕县不能稽征。而潼关属于陕西辖地，河南省陕县烟酒税稽征分局不便派员在装运时稽征，因此矛盾很多。国民党政府财政部经过研究协调，由河南省陕县烟酒税稽征分局在潼关设立驻潼兰州青烟查验办事处，协同陕西第三区烟酒税稽征分局专办青烟查验事务，不征税款。查明应缴特税后，到达指定地点，再由主管特税机关查核征收。为此，河南省印花烟酒税局拟订《查验兰州青烟装运入豫填给应纳特税通知单办法》，经国民党政府财政部税务署核准施行。
     
　　土烟叶特税实行后，最初由各省印花烟酒税局监督征收，在产烟较多或运输便捷的地点设立土烟特税分局专办。如浙江的浙西、萧山、新昌、松阳，安徽的桐庐，河南的博爱，江西的鄱县、广玉等地都设立了土烟叶特税分局。对出产较少的地区，由各省烟酒税分局或稽征所征收。如土烟叶出产在开办薰烟叶统税的区域，则归当地统税管理所征收。湖北的武穴、江西的瑞都、安徽的宿松三地盛产土烟叶，均以江西的九江为运输集中地。为统一事权，便利征管，国民党政府财政部特设九江土烟叶特税办事处，专管三地的土烟叶特税，由税务署直接管辖。湖北省的老河口与河南省的邓县是土烟叶主要产地，两县产地毗邻，而邓县的土烟叶大多运到湖北，老河口是必经之地。于是援照九江办法，将邓县、老河口两处归并，设老河口土烟叶特税办事处，负责稽征两地的土烟叶特税。起初该办事处由湖北省印花烟酒税局兼管，1934年9月改为土烟叶特税分局，划归湖北省印花烟酒税局直辖。