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烟草野火病菌信号肽预测分析研究获进展

2016年04月29日 来源:云南烟叶信息网 作者:
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  烟草在线据云南烟叶信息网报道  野火病是烟草上的主要叶斑类病害,大部分病原菌的毒素、细胞壁降解酶等致病因子为分泌蛋白,信号肽在分泌蛋白跨膜、转运及识别植物受体蛋白过程中起着非常重要的作用。信号肽一般由10-40个氨基酸残基组成,通常大致分为3个区段:其中,N端为碱性氨基末端,通常由带正电荷的氨基酸组成;中间,为疏水中心,主要由20个或以上的中性氨基酸组成;C端,为加工区,含有被信号肽酶裂解的部位,其中小分子氨基酸如甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸较多。

  发表在2016年第1期《中国烟草学报》上的“烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1信号肽预测及分析”研究,利用SignalP 4.0、LipoP1.0及TMHMMv2.0,对分离自四川越西县烟草病样上的一株致病力很强的烟草野火病菌株Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测分类,确定其中432个ORFs (Open reading frame)所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽(SPI),81条脂蛋白型信号肽(SPII)。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11-42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间高度保守。

  该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因,提高了对该病菌致病因子的筛选效率。

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